O LAFOT-CM conta ainda com um cluster computacional para realização de cálculos teóricos empregando a teoria do funcional de densidade (DFT/TD-DFT). O cluster conta atualmente com 280 processadores, 1.3 TB de memória RAM, e aproximadamente 1.5 Tflops de capacidade máxima de processamento. Os softwares G09 (Revisão E.01), Dalton e Orca, dentre outros.